Субъект действия в вопросах

Они же вопросы к подлежащему

Самым простым и понятным примером тут является:
Кто видел тебя? – Кого видел ты?
Who saw you? – Who did you see?

Что тревожит тебя – what troubles you?
Кто из вас знал его – which of you knew him?